5月17日夜，上海日租界的森田株式会社，连雇员在内共十四名日本人全部被人杀死。让日本人思不得其解的是，这些人死时没有一个人发出声响，而且他们的头颅全部被人割下。据说，这些人大多是日本退伍军人。其中，日本陆军大将明石元二郎的侄明石正毅也在其中。
6月2日，徐彦卓接到徐世昌的电报，让他速速赶到北京。
6月5日，徐彦卓赶到北京。当天夜里，徐彦卓一直陪着袁世凯，谁也不知道他们变了些什么。从这一天开始，袁世凯的卫队长袁锐便跟随了徐彦卓。
6月6日上午，一个惊人的消息传遍北京城中华民国大总统袁世凯已于上午10点过几分死亡，死于尿毒症。
袁世凯去世了，徐世昌、段祺瑞、王士珍、张镇芳四人立即打开金匮石屋，找到了袁世凯留下的继承者的提名，只见上面亲笔写着黎元洪、段祺瑞、徐世昌。按照《中华民国临时约法》的规定，前任总统所推荐的人，将作为总统的候选人，从人中选出一人为总统。
6月7日，黎元洪出任大总统黎元洪出任大总统
由于袁世凯死的时候仍旧是在职的总统，黎元洪在继任总统后以在职国家元首的规格给他治丧。中央政府拨款五十万公款用作丧葬费，通令武机关下半旗致哀，并停止宴乐二十七天。民间娱乐也停七天；武官员和驻京部队一律佩戴黑纱；设立“恭办丧礼处”，以曹汝霖、王揖唐、周自齐人承办大典丧礼，黎元洪、徐世昌、段祺瑞人总负责。
袁世凯死后。那些在护国战争中明里暗里背叛他的袍泽故旧也纷纷冰释前嫌，或亲自或派代表赶到北京沉痛悼念袁世凯，以袁世凯的葬礼办得风风光光，备哀荣。
袁世凯的灵堂设在中南海怀仁堂，从6月6日到27日，共停灵21天。在此期间，京城的武官每日按班次前来致祭行礼。驻京部队也分批前来，举枪致哀。灵堂外面，还搭建了数座牌坊。另有京城内外的高僧、名道和喇嘛也来念经颂佛，超杨总统亡魂。
各界名人纷纷送来挽联。
黎元洪的挽联：华夏日重光，回思缔造艰难，亿兆生灵应感泣；勋名天不朽。息受终危急。万几擘画失师赀。
冯国璋的挽联：为天下痛，更哭其私，一柱存亡关气运；如四时行，成功者退，千秋华夏仰威灵。
杨的挽联：共和误民国？民国误共和？面世而后，再平是狱；君宪负明公？明公负君宪？九泉之下，复斯言。
蔡锷的挽联：
辛亥革命，你在北。我在南，野心勃勃。难容正人，惧我怕我，竟欲杀我；海内兴师，上为国，下为民，雄师炎炎，义无反顾，骂你笑你，今天吊你。
最让人看不透的是以下二联：
袁世凯的自挽联：为日本去一大敌；看中国再造共和。
徐彦卓的挽联：往昔个半握拳，今朝孤行者长叹。
6月28日，袁世凯的灵柩从北京起运到河南彰德，起灵的杠木棺罩用的是皇家规格，新华门内用十二人的小杠，出新华门后改为八十人的大杠，一上黄土垫道，并有警察开道、陆军仪仗队一个团、海军仪仗队一个连，外加武官、亲朋故旧，共计两千人前来送行，人山人海，盛况空前，比当年慈禧后的葬礼热闹多了，京汉铁客运还为此停运一天。
……
7月7日，徐彦卓应张作霖的邀请，从北京坐火车来到了奉天。